Comprendre les effets de la pandémie sur la prescription d'antibiotiques et l'antibiorésistance

Depuis le début de la pandémie de COVID-19, la recherche et le suivi ont été nécessaires pour guider le choix du traitement des patients en milieu clinique et contribuer aux efforts de ralentissement de la maladie. Cependant, les données n'ont pas toujours été facilement disponibles, en particulier au début de la pandémie. Parce qu’il fallait agir rapidement avec les patients les plus gravement atteints, les prestataires de soins ont été amenés à prescrire de manière empirique en s'appuyant sur leur expérience et leurs observations mais sans disposer de données de veille utiles. Si un traitement empirique est essentiel pour les patients gravement touchés, il peut également contribuer à l'usage inutile d'antibiotiques, aggravant ainsi l'antibiorésistance.

Selon la définition de l'OMS, l'antibiorésistance est un processus naturel qui se produit lorsque des bactéries, des virus, des champignons et des parasites évoluent au fil du temps et ne réagissent plus aux médicaments mis au point pour les éradiquer. Bien que l'antibiorésistance soit un processus naturel, elle est fortement accélérée par l'usage abusif et la surconsommation d'antibiotiques chez l'homme et l'animal. L'antibiorésistance, qui progresse chaque année, constitue une menace immédiate et grave pour la santé publique.

Les antibiotiques servent uniquement à traiter les infections bactériennes et sont inefficaces contre les infections virales, dont le SARS-CoV-2. De nombreuses études indiquent que l'usage fréquent d'antibiotiques pendant la pandémie de COVID-19 a eu des effets considérables sur l'antibiorésistance, en particulier lors des premières phases de la pandémie, pendant lesquelles les antibiotiques ont été encore plus largement prescrits. De nombreux patients atteints du COVID-19 ayant reçu un traitement antibiotique ont été suspectés de présenter une co-infection ou une infection secondaire bactérienne. Il est toutefois important de noter que « sur la base de la situation clinique, il est difficile de distinguer une infection pulmonaire bactérienne d'une infection pulmonaire virale.»

Selon une étude publiée par The Lancet, la présence de co-infections bactériennes et d'infections bactériennes secondaires chez les patients atteints de COVID-19 est généralement de l'ordre de 5,3 % et 18,4 % respectivement. Malgré une faible prévalence des co-infections et des infections secondaires, l'usage d'antibiotiques est élevé, de l'ordre de 50 à 75 %. L'étude montre également que, parmi les patients COVID-19 atteints d'infections bactériennes, 60,8 % sont résistants aux antibiotiques.

Ces données soulignent la nécessité de réduire la surconsommation d'antibiotiques et de mieux comprendre les effets du COVID-19 sur l'antibiorésistance. De nouvelles données indiquent que la hausse des hospitalisations liées au COVID-19 est associée à une augmentation des infections antibiorésistantes, notamment le Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline (SARM) et l'Enterococcus résistant à la vancomycine.